Konversi gratis di browser · Alat Dock
SMILES ke SDF atau MOL, berkas struktur kembali ke SMILES, atau nama kimia menjadi satu baris SMILES.
Alat gratis Molecular Docking — konversi, lalu dock online sekali klik. Buka beranda docking
Letakkan berkas struktur
.sdf / .mol / .pdb / .smi — konversi tetap di browser
Jalankan pertama mengunduh Open Babel. Setelah itu konversi tetap di perangkat ini.
Hasil muncul di sini. SDF dan MOL juga terunduh.
SMILES adalah satu baris teks molekul. SDF dan MOL adalah berkas struktur yang diminta sebagian besar alat gambar dan persiapan docking. Halaman ini mengonversi format itu di browser, dan bisa mencari nama di PubChem.
SMILES → SDF atau MOL membuat berkas 3D (hidrogen pada pH 7.4). SDF / MOL / PDB → SMILES mengembalikan satu baris. Nama kimia memakai PubChem.
Satu SMILES per baris cukup untuk sejumlah kecil ligan. Untuk berkas, letakkan SDF, MOL, atau PDB.
Salin SMILES, unduh struktur, atau kirim ke AutoDock Vina di Dock. PDBQT untuk Vina lokal ada di konverter lain.
Ini mengisi formulir. Tidak disimpan.
| Senyawa | Pemakaian umum | Yang Anda dapat |
|---|---|---|
| Obat kecil, uji pertama | SMILES ↔ SDF ringkas | |
| NSAID tugas kuliah | Rantai fleksibel, ukuran ligan | |
| Heterosiklik kaku | SMILES pendek, 3D bersih | |
| Flavonoid produk alami | Ligan yang sering dipakai mahasiswa |
Pakai halaman ini untuk “konverter SMILES”: Anda punya SMILES dan butuh SDF atau MOL, atau punya berkas dan butuh baris SMILES. Nama kimia ke SMILES adalah kueri PubChem yang sama.
SMILES atau SDF dari sini masuk ke formulir AutoDock Vina. Itu bukan PDBQT. Untuk baris perintah lokal pakai konverter PDBQT, atau docking online.
Temukan PDB ID resolusi tinggi dari nama protein (EGFR, ACE2, HER2) dan docking dengan satu klik.
Konversi nama obat atau IUPAC ke Canonical SMILES via PubChem — siap untuk AutoDock Vina.
Hapus air HOH dan catatan HETATM opsional dari PDB di browser — prep reseptor siap docking.
Unggah ligand referensi PDB/SDF untuk hitung Center X/Y/Z dan Size kotak pencarian Vina — salin config.txt dengan satu klik.
PDB ID plus SMILES ini. Tanpa memasang Vina atau Open Babel.
Jelajahi hub alat lengkap — pencari PDB, nama ke SMILES, pembersih PDB, kotak grid, aturan 5, PDBQT.